主要是以生態鏈恢復為主體，集成利用植物吸收、基質吸附過濾與微生物降解等措施，對已損壞或退化的水生態系統進行修復或恢復，改善生物群落結構和多樣性，提高水體自凈能力，提升水體水質，最終構建或恢復健康的水生態系統。


1、噬藻多肽生物菌劑引導水生態修復技術

利用噬藻多肽生物菌劑殺死藻類，提高水體透明度，為沉水植被生長提供有利條件，實現沉水植被復壯，增強水體自凈能力，提高濾食性水生動物(魚類和枝角類等水生動物)種群密度;同時集成應用微地形改造、生態護岸、生態浮島、人工濕地、濕地植物優化配置、生物鏈恢復以及水力聯通等多項技術，可有效應用于藻類暴發水體修復。

2、生物鏈引導水生態修復技術

綜合利用濕地植物吸收營養物質和抑制藻類生長、濕地動物濾食藻類以及濕地生物膜的作用，通過種植濕地植物、投放水生動物和形成生物膜，實現有效控制藻類過度繁殖的目的。經長期試驗篩選，獲得兩種有效的生物鏈構建模式，即“鳳眼蓮+浮萍+鰱魚”網狀生物鏈;“鳳眼蓮+浮萍+鰲蝦”并聯生物鏈。該技術可有效應用于藻類暴發水體修復，現已成功應用于太湖三山島。

3、基于生物酶的黑臭底泥生態清淤技術

采用注射裝置將生物酶TH1號注入底泥中，可刺激微生物生長，提高微生物活性，促進底泥降解，不僅可消除黑臭現象，有助于黑臭底泥總量削減，而且使底泥不易再懸浮。該方法見效快，效果持久，在城市水體底泥黑臭治理方面具有明顯優勢，現已成功應用于北京市翠湖濕地。

4、無堵塞長效復合人工濕地技術

以“串/并聯”方式復合運用表流濕地、潛流濕地，并結合向基質投放生物酶，能夠高效快速降解基質截留的污染物，基質不易堵塞，濕地壽命得以延長。該技術可有效緩沖水力和污染負荷的沖擊，且建造和運行費用低，易于維護，可用于生活污水、工業廢水、農田退水和養殖廢水等各類污水的處理，現已成功應用于大北塢河道生態整治工程。